口袋奇兵元素研究中心是游戏后期重要的战略建筑，其核心功能是为全军提供属性加成，包括攻击、增伤、减伤等效果。研究中心的升级需要消耗元素反应器零件，这些材料主要通过海岛商店兑换获取，部分服务器可两天兑换三次，新区则每日限购一次。研究中心分为三个部分：研究院提升生命属性，研究基础增加元素攻击，研究进阶则提供军种专属增益效果。玩家需根据自身兵种配置选择对应的元素属性，通常陆军推荐穿透，海军选择电浆，空军倾向爆炸。
元素研究中心的技能树分为两排，第一排技能仅提升基础攻击数值，第二排技能则解锁增伤、减伤等高级属性。点亮第二排技能的前提是将对应第一排技能升至10级，这一过程需要长期积累资源。不同军种的元素加成效果存在差异，例如穿透元素侧重陆军单位伤害提升，电浆元素增强海军生存能力，爆炸元素优化空军输出效率。玩家需根据主力部队类型优先升级相关技能，避免资源分散导致战力提升缓慢。
研究中心设有元素切换室功能，允许玩家随时调整各军种的元素增益配置。这一机制为战术调整提供了灵活性，在面对不同敌人时可针对性切换属性组合。元素效果作用于全军而非单一兵种，因此即使是未直接强化的次级部队也能获得部分收益。部分高级属性如暴击率、命中率等需要通过特定技能组合激活，这要求玩家对技能联动机制有清晰理解。
资源管理是元素研究中心发展的关键制约因素。除常规的材料收集外，玩家需合理规划技能升级顺序，优先提升主力军种的核心属性。研究所的加成效果与军火库、英雄技能等系统存在乘数关系，因此需要统筹全局发展而非孤立提升单一模块。后期建议定期检查元素配置是否与当前战术体系匹配，及时调整以适应版本环境变化。
